Жените са значително по-податливи на автоимунни заболявания – състояния, при които имунната система на организма погрешно атакува здравите клетки. Въпреки че почти 80% от хората, страдащи от автоимунни заболявания, са жени, тези състояния засягат по-тежко мъжете. Множествената склероза, която атакува главния и гръбначния мозък, засяга три пъти повече жени спрямо мъжете и се предполага, че хормоните играят важна роля. Проучванията продължават във връзка с възможната защитна функция на мъжкия хормон тестостерон.
Освен очевидните физически различия, мъжете и жените също така се различават по отношение на хормоните, органите, социалните и културните влияния, а това води и до различия в здравето им